Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11FIP4Q86YS3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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