Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIBP1Q86W92 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms