Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC190Q86UF4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms