Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMC4Q7Z404 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms