Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT28Q7Z3Y7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT28Q7Z3Y7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms