Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBE3BQ7Z3V4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBE3BQ7Z3V4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms