Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q71RC1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q71RC1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q71RC1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q71RC1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q71RC1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q71RC1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q71RC1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q71RC1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q71RC1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q71RC1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms