Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC149Q6ZUS6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC149Q6ZUS6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms