Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
LRRC9Q6ZRR7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC32■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
LRRC9Q6ZRR7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms