Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LIAT1Q6ZQX7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LIAT1Q6ZQX7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms