Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSMFQ6X4W1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMFQ6X4W1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms