Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CASP12Q6UXS9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CASP12Q6UXS9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms