Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LMBR1LQ6UX01 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMBR1LQ6UX01 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms