Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHISA2Q6UWI4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms