Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSSK4Q6SA08 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSSK4Q6SA08 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms