Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZBED9Q6R2W3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZBED9Q6R2W3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
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