Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LARP1Q6PKG0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LARP1Q6PKG0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms