Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFXN4Q6P4A7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFXN4Q6P4A7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms