Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1R18Q6NYC8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPP1R18Q6NYC8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms