Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RWDD4Q6NW29 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RWDD4Q6NW29 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms