Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RHBDD2Q6NTF9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RHBDD2Q6NTF9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms