Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOBEC3HQ6NTF7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC3HQ6NTF7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms