Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KRT80Q6KB66 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRT80Q6KB66 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms