Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPPQ6IPU0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms