Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCTP1Q6DN14 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCTP1Q6DN14 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms