Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RSBN1Q5VWQ0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms