Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TAF3Q5VWG9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms