Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOCADQ5VW36 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms