Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRCH2Q5VUJ6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRCH2Q5VUJ6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms