Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
MYOM3Q5VTT5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
MYOM3Q5VTT5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYOM3Q5VTT5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms