Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF20Q5VTR2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF20Q5VTR2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms