Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EEF1A1P5Q5VTE0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms