Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC18Q5T9S5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC18Q5T9S5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms