Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYCP2LQ5T4T6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYCP2LQ5T4T6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms