Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALFQ53S48 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ALFQ53S48 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALFQ53S48 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALFQ53S48 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALFQ53S48 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ALFQ53S48 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALFQ53S48 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALFQ53S48 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALFQ53S48 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALFQ53S48 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALFQ53S48 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ALFQ53S48 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALFQ53S48 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALFQ53S48 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALFQ53S48 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALFQ53S48 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ALFQ53S48 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms