Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM259Q4ZIN3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM259Q4ZIN3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms