Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NBPF1Q3BBV0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NBPF1Q3BBV0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms