Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC96Q2M329 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC96Q2M329 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms