Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LRRC36Q1X8D7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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LRRC36Q1X8D7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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LRRC36Q1X8D7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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LRRC36Q1X8D7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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LRRC36Q1X8D7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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LRRC36Q1X8D7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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LRRC36Q1X8D7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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LRRC36Q1X8D7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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LRRC36Q1X8D7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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LRRC36Q1X8D7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRRC36Q1X8D7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms