Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRNQ16849 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms