Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN1Q16799 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN1Q16799 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
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