Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMA3Q16787 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA3Q16787 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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