Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGCBQ16585 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms