Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP35Q16560 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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