Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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