Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZIC1Q15915 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZIC1Q15915 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms