Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CYTH1Q15438 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTH1Q15438 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms