Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF4Q15306 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms