Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB35Q15286 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB35Q15286 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms