Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PRKD1Q15139 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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PRKD1Q15139 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRKD1Q15139 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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